تنه درخت فسیل شده را با تنه آن قبل از فسیل شدن، از نظر شکل ظاهری و ترکیب مواد سازنده مقایسه کنید.
هنگامی که قسمتهای سخت بدن جانداران (مثل تنه درخت) در داخل رسوبات دفن میشوند، آبهای زیرزمینی به داخل این رسوبات نفوذ میکنند. با گذشت زمان، همزمان با حل شدن بخشهایی از جسد جاندار در آب، مولکولهایی از مواد معدنی موجود در آب زیرزمینی (مانند ترکیبات سیلیسی یا آهکی) جایگزین آن میشوند.
بنابراین، مقایسه تنه درخت فسیلشده با تنه آن قبل از فسیل شدن به این صورت است:
از نظر شکل ظاهری: هیچ تغییری در شکل ظاهری، بافت و جزئیات تنه درخت به وجود نمیآید و ظاهر آن کاملاً حفظ میشود.
از نظر ترکیب مواد سازنده: ترکیب شیمیایی و مواد تشکیلدهنده آن کاملاً عوض میشود؛ یعنی مواد آلی چوب جای خود را به مواد معدنی (مثل سیلیس یا آهک) میدهند و تنه درخت به یک سنگ تبدیل میشود.